Για να απεγκαταστήσετε ένα πακέτο, τρέξτε την εντολή: rpm -e package_name.rpm. Βασική ομως προϋπόθεση είναι να γνωρίζετε το ακριβές όνομα του αρχείου που θέλετε να εγκααστήσετε. Αν διατηρείτε ένα σύστημα στο οποίο εγκαθίστανται πάρα πολλά πακέτα και δεν θυμάστε το ακριβές όνομα ενός από αυτά, τότε μπορείτε (για να κάνετε τη ζωή σας εύκολη) να χρησιμοποιήσετε κάποιο εργαλέιο που συνοδεύει το Gnome ή το KDE, όπως το gnorpm για το Gnome, ή το kpackage για το KDE. Αν χρησιμοποιείτε το SuSE distribution μπορείτε να χρησιμοποιήσετε το Y.A.S.T.